Biological Sciences School

Resultado de la investigación 1962 2017

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Conference contribution
2016
1 Citas

A comparative study of differential evolution algorithms for parameter fitting procedures

Torres-Cerna, C. E., Alanis, A. Y., Poblete-Castro, I., Bermejo-Jambrina, M. & Hernandez-Vargas, E. A. 14 nov 2016 2016 IEEE Congress on Evolutionary Computation, CEC 2016. Institute of Electrical and Electronics Engineers Inc., p. 4662-4666 5 p. 7744385

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Biopolymers
Evolutionary algorithms
Mathematical models
2015
1 Citas

A RAD-based linkage map of kiwifruit (Actinidia chinensis Pl.) and map position of genetic determinants of traits of interest to breeders

Scaglione, D., Fornasiero, A., Cattonaro, F., Mesa, K., Pinto, C., Shiny, P., Infante, R., Cooper, T., Meneses, C., Messina, R., Lain, O., Cipriani, G. & Testolin, R. 21 sep 2015 VIII International Symposium on Kiwifruit. International Society for Horticultural Science, Vol. 1096, p. 191-198 8 p. (Acta Horticulturae; vol. 1096)

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kiwifruit
chromosome mapping
Actinidia chinensis
breeding
juvenility
8 Citas

Around the Fungal Clock: Recent Advances in the Molecular Study of Circadian Clocks in Neurospora and Other Fungi

Montenegro-Montero, A., Canessa, P. & Larrondo, L. F. 2015 Advances in Genetics, 2015. Academic Press Inc., Vol. 92, p. 107-184 78 p. (Advances in Genetics; vol. 92)

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Neurospora
Circadian Clocks
Fungi
Proteins
Botrytis

Modeling cell decisions in bone formation

Assar, R., Maass, A., Fernández, J., Kofman, E. & Montecino, M. A. 2015 Analysis, Modelling, Optimization, and Numerical Techniques, ICAMI 2013. Springer New York LLC, Vol. 121, p. 235-245 11 p.

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Bone
Osteoblasts
Biomarkers
Oils and fats
Hybrid systems
2014

High Performance Computing: First HPCLATAM - CLCAR Latin American Joint Conference, CARLA 2014 Valparaiso, Chile, October 20-22, 2014 Proceedings

Hernández, G., Hernández, C. J. B., Díaz, G., Garino, C. G., Nesmachnow, S., Pérez-Acle, T., Storti, M. & Vázquez, M. 2014 High Performance Computing - First HPCLATAM - CLCAR - Latin American Joint Conference, CARLA 2014, Proceedings. Springer Verlag, Vol. 485, (Communications in Computer and Information Science; vol. 485)

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2013
4 Citas

Analysis of gene expression in response to copper stress in Acidithiobacillus ferrooxidans strain D2, isolated from a copper bioleaching operation

Salazar, C. N., Acosta, M., Galleguillos, P. A., Shmaryahu, A., Quatrini, R., Holmes, D. S. & Demergasso, C. S. 2013 Integration of Scientific and Industrial Knowledge on Biohydrometallurgy. Vol. 825, p. 157-161 5 p. (Advanced Materials Research; vol. 825)

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Copper
Genes
Proteins
Bioleaching
Gene encoding
4 Citas

Temporal dynamics of genes involved in metabolic pathways of C and N of L. ferriphilum, in the industrial bioleaching process of escondida mine, Chile

Galleguillos, P. A., Music, V., Acosta, M., Salazar, C. N., Quatrini, R., Shmaryahu, A., Holmes, D. S., Velásquez, A., Espoz, C., Pinilla, C. & Demergasso, C. S. 2013 Integration of Scientific and Industrial Knowledge on Biohydrometallurgy. Vol. 825, p. 162-165 4 p. (Advanced Materials Research; vol. 825)

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Genes
Nitrogen
Bioleaching
Proteins
Carbon
2010
3 Citas

Intermittent warming heat shock on 'Pisana" apricots during postharvest: Sensorial quality and proteomic approach

Seibert, E., Nilo, R., Orellana, A., Rubio, P. & Infante, R. 31 may 2010 Acta Horticulturae. Vol. 862, p. 599-604 6 p. (Acta Horticulturae; vol. 862)

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apricots
chilling injury
cold storage
heat stress
woolliness
1 Citas

The collaboratory for structural nanobiology

Cachau, R. E., Gonzalez-Ibanez, A. M. & Gonzalez-Nilo, F. D. 2010 Nanotechnology 2010. Vol. 3, p. 238-241 4 p.

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Nanobiotechnology
Dendrimers
Fullerenes
Drug delivery
Nanotubes
2009
7 Citas

A 300 kpb genome segment, including a complete set of tRNA genes, is dispensable for Acidithiobacillus ferrooxidans

Levicán, G., Katz, A., Valdés, J., Quatrini, R., Holmes, D. S. & Orellana, O. 2009 Biohydrometallurgy 2009. Vol. 71-73, p. 187-190 4 p. (Advanced Materials Research; vol. 71-73)

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Genes
Bioinformatics
Bacteria
7 Citas

C-di-GMP pathway in biomining bacteria

Castro, M., Ruíz, L. M., Barriga, A., Jerez, C. A., Holmes, D. & Guiliani, N. 2009 Biohydrometallurgy 2009. Vol. 71-73, p. 223-226 4 p. (Advanced Materials Research; vol. 71-73)

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Biofilms
Bacteria
Bioleaching
RNA
Proteins
6 Citas

Comparative genomics begins to unravel the ecophysiology of bioleaching

Holmes, D. S., Cárdenas, J. P., Valdés, J., Quatrini, R., Esparza, M., Osorio, H., Duarte, F., Lefimil, C. & Jedlicki, E. 2009 Biohydrometallurgy 2009. Vol. 71-73, p. 143-150 8 p. (Advanced Materials Research; vol. 71-73)

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Bioleaching
Microorganisms
Genes
Carbon
Gene transfer

Fine tuning assessment of research: The hKA index

Krauskopf, E. 2009 12th International Conference on Scientometrics and Informetrics, ISSI 2009. International Society for Scientometrics and Informetrics, p. 1010-1011 2 p.

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Tuning
7 Citas

Gene organization and CO2-responsive expression of four cbb operons in the biomining bacterium Acidithiobacillus ferrooxidans

Esparza, M., Bowien, B., Jedlicki, E. & Holmes, D. S. 2009 Biohydrometallurgy 2009. Vol. 71-73, p. 207-210 4 p. (Advanced Materials Research; vol. 71-73)

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Genes
Metabolism
Enzymes
Bioinformatics
Gene expression
4 Citas

Genomic lessons from biomining organisms: Case study of the Acidithiobacillus genus

Valdes, J. H. & Holmes, D. S. 2009 Biohydrometallurgy 2009. Vol. 71-73, p. 215-218 4 p. (Advanced Materials Research; vol. 71-73)

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Microorganisms
Genes
Biodiversity
Gene transfer
Bioleaching
4 Citas

Organization, integration, and assembly of genetic and epigenetic regulatory machinery in nuclear microenvironments: Implications for biological control in cancer

Stein, G. S., Zaidi, S. K., Stein, J. L., Lian, J. B., Van Wijnen, A. J., Montecino, M., Young, D. W., Javed, A., Pratap, J., Choi, J. Y., Ali, S. A., Pande, S. & Hassan, M. Q. feb 2009 Steroid Enzymes and Cancer. Vol. 1155, p. 4-14 11 p. (Annals of the New York Academy of Sciences; vol. 1155)

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Epigenomics
Gene Expression
Neoplasms
Blood Flow Velocity
Carcinogenesis
3 Citas

Predicted CO/CO2 fixation in Ferroplasma spp. via a novel chimaeric pathway

Cárdenas, J. P., Martínez, V., Covarrubias, P., Holmes, D. S. & Quatrini, R. 2009 Biohydrometallurgy 2009. Vol. 71-73, p. 219-222 4 p. (Advanced Materials Research; vol. 71-73)

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Carbon
Microorganisms
Carbon dioxide
Enzymes
Genes

Predicting the function of hypothetical genes in genomes of bioleaching microorganisms

Ossandón, F. J., Rivera, G., Lazo, F. & Holmes, D. S. 2009 Biohydrometallurgy 2009. Vol. 71-73, p. 203-206 4 p. (Advanced Materials Research; vol. 71-73)

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Genes
Microorganisms
Bioleaching
Bioinformatics
Metabolism
6 Citas

Prediction of FNR regulated genes and metabolic pathways potentially involved in anaerobic growth of Acidithiobacillus ferrooxidans

Osorio, H., Cárdenas, J. P., Valdés, J. & Holmes, D. S. 2009 Biohydrometallurgy 2009. Vol. 71-73, p. 195-198 4 p. (Advanced Materials Research; vol. 71-73)

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Bioleaching
Genes
Microorganisms
Sulfur
Iron
1 Citas

Protein function in extremely acidic conditions: Molecular simulations of a predicted aquaporin and a potassium channel in Acidithiobacillus ferrooxidans

Duarte, F., Araya-Secchi, R., González, W., Perez-Acle, T., González-Nilo, D. & Holmes, D. S. 2009 Biohydrometallurgy 2009. Vol. 71-73, p. 211-214 4 p. (Advanced Materials Research; vol. 71-73)

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Proteins
Membranes
Potassium
Molecular dynamics
Molecular modeling
7 Citas

Regulation of expression of the PetI operon involved in iron oxidation in the biomining bacterium Acidithiobacillus ferrooxidans

Lefimil, C., Osorio, H., Quatrini, R., Holmes, D. & Jedlicki, E. 2009 Biohydrometallurgy 2009. Vol. 71-73, p. 199-202 4 p. (Advanced Materials Research; vol. 71-73)

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Iron
Oxidation
Bacteria
Electrons
Transcription factors
3 Citas

Small regulatory RNAs in Acidithiobacillus ferrooxidans: Case studies of 6S RNA and Frr

Shmaryahu, A., Lefimil, C., Jedlicki, E. & Holmes, D. S. 2009 Biohydrometallurgy 2009. Vol. 71-73, p. 191-194 4 p. (Advanced Materials Research; vol. 71-73)

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RNA
Microorganisms
Genes
Bioleaching
Microbiology
2008

Preliminary genomic and functional analysis of a cDNA library from Botrytis cinerea

Silva, E. M., Valdés, J., Shmaryahu, A., Holmes, D. & Valenzuela, P. ene 2008 Proceedings of the Ninth International Rubus and Ribes Symposium. Vol. 777, p. 197-201 5 p. (Acta Horticulturae; vol. 777)

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Botrytis cinerea
genes
cDNA libraries
bioinformatics
small fruits
2007
2 Citas

Discovery of small regulatory RNAs extends our understanding of gene regulation in the Acidithiobacillus genus

Shmaryahu, A. & Holmes, D. S. 2007 Biohydrometallurgy. Vol. 20-21, p. 535-538 4 p. (Advanced Materials Research; vol. 20-21)

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RNA
Gene expression
Microorganisms
Bioinformatics
Bacteria
9 Citas

Insights into the metabolism and ecophysiology of three acidithiobacilli by comparative genome analysis

Valdes, J., Pedroso, I., Quatrini, R., Hallberg, K. B., Valenzuela, P. D. T. & Holmes, D. S. 2007 Biohydrometallurgy. Vol. 20-21, p. 439-442 4 p. (Advanced Materials Research; vol. 20-21)

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Genes
Oxidation
Nitrogen fixation
Bioleaching
Microorganisms
2 Citas

Iron homeostasis strategies in acidophilic iron oxidizers: Comparative genomic analyses

Quatrini, R., Martínez, V., Osorio, H., Veloso, F. A., Pedroso, I., Valdés, J., Jedlicki, E. & Holmes, D. S. 2007 Biohydrometallurgy. Vol. 20-21, p. 531-534 4 p. (Advanced Materials Research; vol. 20-21)

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Iron
Genes
Bioleaching
Metals
Physiology
2006
4 Citas

Preliminary study on edible film with a natural plant extract to improve quality of fresh fruits for supply chains

Ihl, M., Bifani, V., Ramírez, C., Rubilar, M., Motomura, Y., Seguel, I., Meneses, C. & Infante, R. jun 2006 Proceedings of the Fourth Int. Conference on Managing Quality in Chains. Vol. 712 II, p. 617-622 6 p. (Acta Horticulturae; vol. 712 II)

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films (materials)
edible films
fruits
ecotypes
permeability
6 Citas

Present situation of peach breeding programs: Post harvest and fruit quality assessment

Infante, R., Meneses, C. & Byrne, D. H. jul 2006 Proceedings of the Sixth International Peach Symposium. Vol. 713, p. 121-124 4 p. (Acta Horticulturae; vol. 713)

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breeding
fruit quality
seedlings
cultivars
new variety
7 Citas

Sensorial post-harvest quality evolution in apricot (Prunus armeniaca L.) cultivars 'Palsteyn' and 'Grandir'

Infante, R., Kraemer, F., Luchsinger, L., Meneses, C. & Aros, D. sep 2006 Proceedings of the XIIIth International Symposium on Apricot Breedin and Culture. Vol. 717, p. 321-325 5 p. (Acta Horticulturae; vol. 717)

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apricots
color
cold storage
titratable acidity
firmness
2005
21 Citas

Vaccination strategies to prevent emerging diseases for Spanish aquaculture

Romalde, J. L., Ravelo, C., López-Romalde, S., Avendaño-Herrera, R., Magariños, B. & Toranzo, A. E. 2005 Progress in Fish Vaccinology. Vol. 121, p. 85-95 11 p. (Developments in Biologicals; vol. 121)

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Flatfishes
Aquaculture
Vaccination
Bacterial Vaccines
Vaccines
1986
3 Citas

CONSTRUCTION AND USE OF MOLECULAR PROBES TO IDENTIFY AND QUANTITATE BIOLEACHING MICROORGANISMS.

Yates, J. R. & Holmes, D. S. 1986 Unknown Host Publication Title. Lawrence, R. W., Branion, R. M. R. & Ebner, H. G. (eds.). Elsevier (Process Metallurgy 4), p. 409-418 10 p.

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Microorganisms
Bioleaching
Bacteria
DNA sequences
Precipitates
4 Citas

MOLECULAR PROBES FOR THE IDENTIFICATION AND QUANTITATION OF MICROORGANISMS FOUND IN MINES AND MINE TAILINGS.

Yates, J. R. & Holmes, D. S. 1986 Biotechnology and Bioengineering Symposium. 16 ed. John Wiley & Sons, p. 301-309 9 p.

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Thiobacillus
Molecular Probes
Southern Blotting
Genes

STUDY OF THIOBACILLUS FERROOXIDANS PENETRATION DEPTH INTO LUMP COAL USING X-RAY COMPUTED TOMOGRAPHY.

Maylotte, D. H., Spiro, C. L., Lobos, J. H. & Holmes, D. S. 1986 Unknown Host Publication Title. Lawrence, R. W., Branion, R. M. R. & Ebner, H. G. (eds.). Elsevier (Process Metallurgy 4), p. 483 1 p.

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Tomography
Coal
X rays
Bituminous coal
Polyethylenes